Am 15. April berichtete der faktische Leiter des Zentralen Wahlkomitees der international nicht anerkannten Republik Bergkarabach Srbuhi Arzumanjan über die vorläufigen Ergebnisse der zweiten Runde der Präsidentschaftswahlen, die am 14. April stattfanden. Nach den vorläufigen Ergebnissen gewann Arayik Harutjunjan mit 88% der Stimmen die Wahl, während sein Rivale Masis Mailjan nur 12% der Stimmen erhielt. Die Wahlbeteiligung lag bei 45%. 

Harutyunyan sprach über seinen Sieg und beschuldigte seine Gegner, das Coronavirus-Problem in der Region zu politisieren. Ihm zufolge war das Verhalten der Gegner und die Aufforderung, die Wahlen zu verschieben, nicht von der Sorge um die Bevölkerung inmitten der Pandemie bestimmt, sondern von der Erkenntnis, was das Ergebnis der Abstimmung gewesen wäre. Er versicherte jedoch, dass er keine Probleme mit einzelnen Politikern oder Persönlichkeiten habe und fügte hinzu, dass es keine politischen Verfolgungen geben würde.

Sein Rivale Mailjan forderte die Wähler in Bergkarabach auf, während der Pandemie nicht an den Wahlen teilzunehmen. Er weigerte sich auch, an den Fernsehdebatten teilzunehmen. Bereits vor der ersten Wahlrunde haben eine Reihe von Oppositionellen Proteste abgehalten, in denen gefordert wurde, dass die De-facto-Behörden aufgrund der Coronavirus-Pandemie einen Ausnahmezustand verhängen, einschließlich der Verschiebung der Wahlen.

Am 12. April erklärte der noch amtierende De-facto-Präsident von Bergkarabach, Bako Saakjan, eine Coronavirus-bedingte „Notsituation“ in der Region, nachdem 6 Fälle von Covid-19-Infizierten gemeldet worden waren. Die Notstandsregel verbot öffentliche Versammlungen, beschränkte die Verkehrsanbindung innerhalb von Karabach und verbot Bürgern Armeniens und anderer Länder die Einreise in die Region. Saakjan machte jedoch klar, dass die zweite Runde der Präsidentschaftswahlen wie geplant verlaufen würde. 

Das aserbaidschanische und das georgische Außenministerium reagierten als erste auf die zweite Runde der Präsidentschaftswahlen in dem international nicht anerkannten Gebiet. „Der Präsident von Aserbaidschan, Ilham Alijew, hat... festgestellt, dass diese Wahlen erneut gezeigt haben, dass niemand dieses illegale Junta-Regime anerkennt. Wir betonen noch einmal, dass diese vom Besatzungsland organisierten Wahlen unabhängig von der Wahlphase nichts anderes als ein Trickspiel ohne Rechtskraft sind“, sagte die Sprecherin des aserbaidschanischen Außenministeriums Leyla Abdullajewa.

„Die georgische Seite erkennt die sogenannte Unabhängigkeit von Bergkarabach nicht an und erkennt daher die zweite Runde der sogenannten Präsidentschaftswahlen in der Region Aserbaidschan nicht an. Georgien unterstützt die territoriale Integrität und Souveränität der Republik Aserbaidschan innerhalb international anerkannter Grenzen und unterstützt die friedliche Beilegung des Konflikts auf der Grundlage der Grundsätze und Normen des Völkerrechts“, heißt es in der Erklärung des georgischen Außenministeriums.

Am 31. März wurden die Wahlen zum neuen De-facto-Präsidenten und zum Parlament von Bergkarabach trotz einer Reihe von Aufforderungen zu ihrer Verschiebung organisiert. Die Partei des Freien Vaterlandes von Harutyunjan gewann mehr als 40 Prozent der Stimmen für das De-facto-Parlament und wird 16 der 33 Sitze kontrollieren, während die größte Oppositionskraft die Partei der Vereinigten Heimat von Samvel Babajan war, die 9 Sitze erhielt.

Die Wahlen wurden von vielen Ländern verurteilt, darunter Georgien, die Ukraine, Moldawien, die Türkei und der Iran. Der Direktor für Osteuropa, Kaukasus und Zentralasien des Auswärtigen Amtes, Michael Siebert, twitterte, dass sowohl die Wahlen als auch ihre Ergebnisse aus deutscher Sicht als illegal angesehen würden. Die Ko-Vorsitzenden der OSZE-Minsk-Gruppe (Igor Popov, Stéphane Visconti und Andrew Schofer), die den Vermittlungsprozess des Bergkarabach-Konflikts leiten, akzeptierten die Ergebnisse dieser Wahlen nicht als Auswirkungen auf den rechtlichen Status von Bergkarabach und betonten, dass die Ergebnisse in keiner Weise den endgültigen Status von Bergkarabach oder das Ergebnis der laufenden Verhandlungen zur dauerhaften und friedlichen Beilegung des Bergkarabach-Konflikts vorwegnehmen. Ähnliche Erklärungen wurden von der EU und der NATO abgegeben.